新疆位于欧亚大陆腹地，地域辽阔，面积166.49万平方公里，约占国土面积的1/6。属于典型的内陆干旱地区，自然环境区域差异明显，自然景观多样，拥有森林、荒漠、湿地、草原、沙漠和高原苔地等各种类型的生态系统，野生动植物资源丰富。随着新疆自然保护区的建设和发展，越来越多的珍稀动植物得以与人类共享家园。

我国自然保护区事业通过长期探索，逐步形成了具有中国特色的保护管理制度，可以简单地概括为“分类分区分级分部门”管理制度。【分类】我国自然保护区一般按主要保护对象的不同分为生态系统、野生生物和自然遗迹三大类别9种类型。【分级】按事权划分原则，我国自然保护区分为4级：国家级、省（自治区、直辖市）级、市（自治州）级、县（自治县、旗、县级市）级。【分区】在自然保护区内部按照主导功能性差异分为核心区、缓冲区和实验区，分别对各功能区实施不同的管理政策。【分部门】我国自然保护区采用综合管理与分部门管理相结合的管理体制。

珈和根据新疆省环保厅、林业厅、农业厅、国土厅等部门发布的自然保护区名录，以及自然保护区功能区划图，收集截止2018年4月的新疆自然保护区本底资料。在2000国家大地坐标系（CGCS2000）下，基于高分辨率卫星影像，通过图上同名点的地理匹配，以及经纬网格间的误差计算，实现自然保护区功能区划图与卫星影像之间的地理配准。然后，对每个自然保护区的核心区、缓冲区及实验区进行面状要素矢量化。最后，对面状要素进行拓扑检查，修改合格后，完成新疆省国家级自然保护区分布数据的制作，共计15个国家级自然保护区。

（1）新疆艾比湖湿地国家级自然保护区

位于我国西北部边陲，地处大西洋西风气流的主要通道——阿拉山口，整个湿地处于阿拉山口的风道区。因为是咸水湖，人们又俗称其为盐湖。艾比湖区中，有丰富的盐、硭硝、硫酸镁、硼、溴、碘等非金属矿藏。保护区保护对象为咸水湖和具有独特的湿地生态环境和丰富的生物多样性资源。

（2）新疆温泉北鲵国家级自然保护区

位于新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州温泉县境内。新疆北鲵是距今3.5亿年的孑遗物种，俗名娃娃鱼，为目前新疆唯一存活下来的有尾两栖动物，是天山和阿拉套山抬升时存活至今的孑遗物种，与恐龙同处一个发展年代，被称为“活化石”，具有重要学术意义和潜在的经济价值。

（3）新疆罗布泊野骆驼国家级自然保护区

位于欧亚大陆腹地中国新疆维吾尔自治区，区地处温带、暖温带荒漠地带，气候干旱、植被稀疏，自然条件十分严酷。保护区是典型的极旱荒漠类型保护区，也是世界极度濒危物种——野骆驼的模式产地。

（4）新疆塔里木胡杨国家级自然保护区

位于新疆巴音郭楞蒙古自治州尉犁、轮台两县境内，属戈壁荒漠、大陆性荒漠、半荒漠生物群落的类型。保护区主要保护对象是塔里木盆地内陆干旱区中以胡杨林荒漠生态系统。塔里木胡杨保护区是世界上原始胡杨林分布最集中、保存最完整、最具代表性的地区。

（5）新疆阿尔金山国家级自然保护区

位于新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州若羌县境内，与青海和西藏相毗邻，面积45000平方公里，平均海拔高度4600米以上。阿尔金山国家级自然保护区边远偏僻、高寒缺氧，使得保护区内保留了中国特有和珍稀的野生动物。由于保护区独特的地理环境和丰富的自然资源，IUCN（世界自然与自然资源保护联盟）、WWF（世界野生生物基金会）联合考察后在报告序言中称，这里是“世界上少有的生物地理省之一，是不可多得的高原物种基因库”。保护区在1983年建立的当年，即被收录到《大英百科全书》名录中。并被中国列入《中国生物多样性保护行动计划》优先保护名录。

（6）新疆巴音布鲁克国家级自然保护区

位于新疆维吾尔自治区和静县境内，主要保护对象为天鹅等珍稀水禽及其栖息繁殖地。保护区内山势平坦，周围山地冰雪融水汇聚形成湖泊、沼泽，草类生长繁茂，为水禽的生活、繁殖提供了良好条件，是全国第一个天鹅自然保护区。

（7）新疆托木尔峰国家级自然保护区

位于新疆维吾尔自治区阿克苏地区温宿县境内，属森林生态系统类型自然保护区。保护区内受保护的高等植物382种，代表性有雪莲花、高山黄芪等，野生动物主要包括陆栖脊椎动物77种，隶属13目28科73属；昆虫1000余种。

（8）新疆伊犁小叶白蜡国家级自然保护区

位于新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州伊宁县境内，区内生物多样性丰富，有着距今7000万年—100万年的第三纪温带落叶阔叶林孑遗植物——小叶白蜡天然林，是国内唯一集中分布天然小叶白蜡种群，具有很高的自然保护价值和科学研究价值。

（9）新疆霍城四爪陆龟国家级自然保护区

位于新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州霍城县境内，地处天山支脉阿克拉斯山山前的黄土丘陵地带，属于珍稀野生动物自然保护区。主要保护对象为珍稀动物四爪陆龟及其生境。四爪陆龟是国家一级珍稀保护动物，在我国仅分布于霍城县的荒漠丘陵中，是世界仅有的三种陆龟之一。

（10）新疆西天山国家级自然保护区

位于中天山西段伊犁地区境内，主要保护对象是云杉林及其生境。这里年降水量达800─1000毫米，达到亚热带的降水水平，是新疆降水量最高的地区，被誉为干旱荒漠中的“湿岛”。保护区内保存了我国西部最大的原始针叶林和天山仅存的带状分布的阔叶林，保护区内的森林呈原始状态且大面积分布。

（11）新疆甘家湖梭梭林国家级自然保护区

位于准噶尔盆地西南部，属艾比湖盆地，保护区地跨新疆塔城地区乌苏市和博尔塔拉蒙古自治州精河县。主要保护对象为梭梭、白梭梭及其生长环境。保护区是准原始状态下，世界上面积最大、生长最好最集中、保护最完整的荒漠梭梭天然次生灌木林区，也是我国唯一的温带荒漠地带的梭梭荒漠生态保护区。

（12）新疆巴尔鲁克山国家级自然保护区

位于新疆塔城地区裕民县、托里县境内，由东西两个区块组成，西区块是野巴旦杏保护区区块，东区块是巴尔鲁克山林场区块。保护区主要保护对象为新疆野苹果等种质资源与雪豹等重点保护野生动物，雪岭云杉林和野巴旦杏林等森林生态系统，是森林生态系统类型的自然保护区。

（13）新疆阿勒泰科克苏湿地国家级自然保护区

位于阿勒泰市境内，地处我国唯一流入北冰洋的河流——额尔齐斯河中下游，是阿勒泰草原上最大的一块湿地。是新疆北部戈壁荒漠中最大的沼泽湿地，属湿地类型自然保护区。

（14）新疆哈纳斯国家级自然保护区

位于新疆维吾尔自治区布尔津县境内，，主要保护对象为寒温带针阔叶混交林生态系和自然景观。保护区自然生态系统保存完整，是我国唯一的欧洲---西伯利亚生物区系的代表，具重要的保护价值和科研价值。

（15）新疆布尔根河狸国家级自然保护区

位于额尔齐斯、乌伦古“两河”源头，是中国惟一的蒙新河狸生息和自然保护区，以珍稀濒危的蒙新河狸和鸟类以及生境为主要保护对象。区内森林草原相间，群落基本保持天然状态，生态系统独特，自然风景优美，特别是国家一类野生保护动物——蒙新河狸在我国唯一集中分布区域，具有很高的自然保护价值和科学研究价值。